মেঘনা একটি নবগঠিত উপজেলা।এই উপজেলাটি ০৮টি ইউনিয়ন নিয়ে গঠিত।১৯৯৮ সালের শেষ ভাগে মেঘনাকে উপজেলা হিসাবে ঘোষনা করা হয়। ইতিপূর্বে এই উপজেলার ০৫টি ইউনিয়ন দাউদকান্দি উপজেলার এবং০৩টি ইউনিয়ন হোমনা উপজেলার অন্তরগত ছিল।যেহেতু এই উপজেলার একপাশে দেশের বৃহত্তম মেঘনা নদী অবস্থিত সেহেতু এই নদীর নাম অনুসারে প্রস্থাবকরা হয় এবং গনপ্রজাতন্ত্রী বাংলাদেশ সরকার মেঘনা নামেই উপজেলার নামকরন করেন।